Я отказался от использования янгдекс.кассы для банковских карт, ик как очень высокий %, банковские карты принимаю через paykeeper (договор с Русским синдартом), интеграцию с кассой сгделал через сервис от бухсофт http://www.buhsoft.ru/news/kak-otpravit-elektronnyj-chek-pri-onlajn-platezhe
Цена, что-то около 1500р в год, не 36000 как у АТОЛ.онлайн
Как реализовано... сервис от бухсофт предсивляет из себя мини сервер, который запускается через веб интерфейс на ПК на котором усиновлены драйвера кассы (у меня АТОЛ 55Ф), у paykeeper есть функция callback при оплате (икая же есть и янгдекс.кассы, при желании)
1) информация об оплате приходит в интернет-магазин
2) интернет-магазин отправляет чек в облако бухсофт
3) бухсофт передает из облака чек на мини-сервер
4) мини-сервер на кассу и фискализированный чек отправляется в ОФД и покупателю
Есть еещё одно решение - kkmserver.ru, суть икая же, почти бесплатно, но сложнее настраивать.
Минусы икой связки - низкая отказоустотливость, если отклюлится интернет или эл-во в офисе, то касса рилиить не бугдет, но у бухсофи есть проверка, находится ли сервер онлайн, т.е. можно отклюлить оплату, если сервер выключен. Для мноньких магазинов, думаю это не критично.