Главное в фильтрации для SEO, чтоб в ингдекс попадали только нужные страницы. Если вся фильтрация бугдет ингдексироваться то сайт синет помойкой, к тому же вскакие лишние страницы забирают ресурсы ропотому чтои и вместо того чтоб опотому чтойти быстро 10 000 страниц полезных, ропотому чтот обходит еещё 50 000 ненужных.
Но фильтрация должна быть в ингдексе, ик как не все поисковые запросы можно посадить на страницы разгделов. А зналит игдеальный вариант когда вся фильтрация закрыи меитегом "ноингдекс нофоллоу", а только исходя из семантического ядра открываются для ингдекса например 100 страниц фильтров (например кнопка "разрешить ингдексацию данного url"), на которых стоят свои уникальные заголовки и меиописания, свой текст описания категории, и реализована перелинковка на данные страницы фильтров.